Digital Drosophila Archive
1.8 KiB
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数据、外部资源与来源链
精确定位而非重新下载
完整逐文件路径、字节数、SHA-256 位于 registry/snapshots/bootstrap-20260929/files.jsonl.gz。
它记录目前服务器实物，不替代上游官方校验，也不证明过去每一次实验的执行过程。
原下载来源/校验文件保留在 datasets/male-cns-v1.0/raw/_manifests/，原 Phase 3B schema/audit 保留在 processed/neuron-only。
自动引用抽取 registry/catalog-20260929/source-citations.json 同时保存来源文件 SHA-256；抽取到的 URL/DOI 未自动背书为有效生物学证据。
外部资源
| 资源 | 本地用途 | 不允许的推断 |
|---|---|---|
| MaleCNS v1.0 / Cell 2026 | canonical bodies、真实边、annotation | anatomical count ≠ 实测有效电导 |
| reiserlab/visualpathways | pathway / receptive-field / retinotopy 参考 | 没有坐标的 neuron 不随机补坐标 |
| Cell Type Explorer / eye maps | 视觉层级和 eye-map 参考 | 名称相似不证明跨数据集 ID 一致 |
| FlyVis | 独立 engineering visual front-end 探索 | 不称为纯 MaleCNS phototransduction |
| DoOR.data 2.0.1 | odor-response physiology、receptor/glomerulus 通道映射 | 不自动推断缺失 MaleCNS body 映射 |
四个外部 Git 仓库的 origin、commit、dirty 状态、许可证据 SHA-256 已锁在 external-resources.lock.json。
外部仓库未 pull、未更新、未被作为嵌套 Git 内容上传。
版本与覆盖缺口
论文 formal / preprint、数据 release、软件 commit 分开标记。未知许可证、缺失映射或没有原始生理参数都显式保留 unknown。 不能因为外部数据“公开可下载”就默认可全部再分发。 不上传大型上游数据副本，恢复时优先使用自己已校验的备份；上游重下载是显式操作，不由本仓库自动执行。