Files
digital-drosophila/models/male-cns-lif/apl-pn-scope-audit-v1/PROTOCOL.md
T

2.4 KiB

Phase 4AA — APL→PN scope audit(预先声明)

接续封存 Phase 4Z,仅做 CPU 解剖/实现范围审计。不重新运行旧科学阶段,不使用 GPU,不影响 ComfyUI。 不训练、不改参数/符号、不增加边、不调整 APL calibration、eligibility-v2 或 14,232 plastic mask。

选择与检验

  • 直接从实际 annotation_type == APL、annotation_class == ALPN / Kenyon_Cell 识别;空 class 不靠名称猜测。
  • 审计所有 APL 入/出边,不只选择七个观察 PN。七个 PN 来自封存 Phase 4Z 的全部真实目标 KC 入源。
  • 从 CSR 独立抽取,再流式过滤原始 Feather,逐 body pair / 原始 count 严格核对。
  • 区分 frozen fast-current out-mask、KC-only graded output、KC/PN-only graded input;输入被 graded 计算忽略不等于原图边被删除。
  • 核对 PN↔APL 双向边、PN→KC 与 PN→ALLN 出边;这只证明解剖路径,不宣称空间/生理因果。
  • 检查真实 schema 是否含接触位置、ROI、靶位点受体;SWC centerline 不等同 synaptic partner 坐标。
  • 保存 Phase 4Z 所用运行时代码相关段落与 SHA-256,核实覆盖数量完全一致。

未知与停止条件

缺失的接触 ROI、末梢位置、受体和作用系数均记 unknown。 有配对边和论文支持不等于这只 MaleCNS 中某条连接已经定位到 calyx bouton。 不得据本审计自动恢复 APL→PN whole-cell negative current 或扩大 graded target matrix。 官方 syn-partners/syn-points 只获取 HEAD 元数据;不自动下载数 GB 数据,不请求 EM。 若继续定位需 neuPrint 授权或新的官方附加数据,输出具体需求,不猜测补齐。

通过的含义

audit PASS = 原始边核对通过、覆盖重建与 Phase 4Z 相符、旧文件哈希不变、未知被保留。 不等于 learning PASS,不产生新的正式模型候选。全项目顶层 gate 保持 5/10。 复现用新的 experiment_root;禁止覆盖任何已经封存的输出目录。

证据

Google/Janelia 的解剖数据与论文用于约束来源和机制;不能替代受体/电导测量或学习任务验证。