Digital Drosophila / MaleCNS 全脑模型研究

面向 MaleCNS v1.0 的可审计连接组、LIF 模型、感觉接口与局部可塑性机制研究。 这是研究工程仓库，不是已经实现自主学习或游戏控制的果蝇。

截至 2026-10-01，最新正式封存科学阶段仍是 Phase 4AQ：PASS-EXACT-UPDATED-BOUNDARY-ENGINEERING-NOT-LEARNING。 Phase 4AR 已按用户要求停止，暂不恢复：已提交 1,033/30,000 轮训练及 CPU 校验、138/3,920 次独立 probe；执行尚未完成，学习成功未判定。本分支 codex/v100-conditioning-acceleration 同时保留 CPU 与 GPU 方案及两轮独立性能回放。它不是已升级的生产运行时；原登记实验和权重没有改动。远端默认分支仍为初始化分支，见分支说明。项目顶层验收口径为 5/10（50%）；这不是生物学逼真度、工作量完成率或剩余工期。最新正式候选运行时为 MaleCNS-LIF-runtime-v2-deterministic-candidate。 MaleCNS-TemporalEligibility-v2-candidate 与 MaleCNS-OlfactoryEncoder-v1-candidate 保留。稳定信用分配、刺激特异性关联记忆和游戏学习尚未通过。

从这里开始

主题	文档
最新运行状态、证据与下一步	当前状态、CPU/GPU 保存说明
顶层验收比例与历史基线	项目状态
目录和数据流	架构与目录
科学数据定义和来源	数据契约、来源登记
模型边界	模型与冻结契约
论文、引用与证据用途	参考文献入口、证据边界
环境与复现	环境、恢复
Git 同步、大数据备份与安全	同步说明、备份
每个阶段的原始证据副本	阶段索引
全部科学文件路径/大小/SHA-256	快照说明

关键事实

正式输入：datasets/male-cns-v1.0/processed/neuron-only/。
166,700 个神经元；25,582,938 条有向边；124,177,617 个原始 synaptic contacts。
原始 connectome、权重、神经递质定义和所有历史冻结阶段保持原位，只读管理。
模型准确名称：Shiu-like LIF dynamics adapted to MaleCNS v1.0，不声称严格复现 Shiu 原模型。
无游戏接入验收，无批准的自主行为学习候选；历史探索输出仍保留在服务器。

Git 与数据不是同一个备份

服务器项目根目录：/data/digital-drosophila/。远程：ssh://git@192.168.10.31:2222/qishizhe/digital-drosophila.git。初始化／当前远端默认分支：codex/project-bootstrap；注册科学源码分支：codex/lif-author-semantics-lab；最新独立加速成果：codex/v100-conditioning-acceleration。

Git 保存源代码、配置、文档、书目、阶段证据副本和逐文件哈希清单。普通 Git 不直接保存大型科学二进制。获准公开再分发的原始/参考数据已在 codex/lfs-public-resources 通过 Git LFS 归档；本分支另通过 LFS 保存本次 CPU/GPU 回放的科学结果。没有上传虚拟环境、SDK 编译缓存、凭据或其他服务的数据。原项目实占约 29.72 GB（十进制、初始化前统计），不会因为初始化 Git 被删除、搬移或重写。只取得 Git pointer 不能恢复全数据；需下载对应分支的 LFS 对象并验证内部成员。本次恢复说明见 CPU/GPU 发布入口。这不是全服务器灾备。

安全的首次检查

GIT_LFS_SKIP_SMUDGE=1 git clone --branch codex/v100-conditioning-acceleration ssh://git@192.168.10.31:2222/qishizhe/digital-drosophila.git
cd digital-drosophila
python3 -B tools/repo_guard.py

完整数据恢复后才能运行 SHA-256 验证。不要直接执行旧阶段的生成/封存脚本：部分脚本使用固定输出路径，会覆盖历史结果。本次仓库建设不重新运行任何科学阶段。

权属与引用

见 NOTICE。第三方数据、软件和论文各自保留其许可证；本仓库没有替用户擅自授予全项目开源许可证。论文索引不是论文全文打包；保留 DOI、官方全文入口、版本及证据用途，避免错误再分发。

4.6 KiB Raw Permalink Blame History Unescape Escape