Preserve CPU and GPU acceleration plans, evidence and LFS archives; mark research paused

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Digital Drosophila Archive
2026-10-01 15:45:19 +08:00
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commit f2de879737
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面向 MaleCNS v1.0 的可审计连接组、LIF 模型、感觉接口与局部可塑性机制研究。
**这是研究工程仓库,不是已经实现自主学习或游戏控制的果蝇。**
截至 2026-10-01 00:09(Asia/Shanghai),最新封存阶段是 **Phase 4AQ:PASS-EXACT-UPDATED-BOUNDARY-ENGINEERING-NOT-LEARNING**。
**Phase 4AR 普通嗅觉 acquisition 正在执行,科学结论未判定**:采样时已提交 411/30,000 轮训练及 CPU 校验、62/3,920 次独立 probe;不是实时自动更新计数。
最新研发分支为 `codex/lif-author-semantics-lab`,远端默认分支仍为初始化分支。本页状态不表示已完成分支合并。
截至 2026-10-01,最新正式封存科学阶段仍是 **Phase 4AQ:PASS-EXACT-UPDATED-BOUNDARY-ENGINEERING-NOT-LEARNING**。
**Phase 4AR 已按用户要求停止,暂不恢复**:已提交 1,033/30,000 轮训练及 CPU 校验、138/3,920 次独立 probe;执行尚未完成,学习成功未判定。
本分支 `codex/v100-conditioning-acceleration` 同时保留 CPU 与 GPU 方案及两轮独立性能回放。它不是已升级的生产运行时;原登记实验和权重没有改动。远端默认分支仍为初始化分支,见[分支说明](docs/40-operations/branches-20261001.md)。
项目顶层验收口径为 **5/10(50%)**;这不是生物学逼真度、工作量完成率或剩余工期。
最新正式候选运行时为 `MaleCNS-LIF-runtime-v2-deterministic-candidate`。
`MaleCNS-TemporalEligibility-v2-candidate` 与 `MaleCNS-OlfactoryEncoder-v1-candidate` 保留。
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| 主题 | 文档 |
|---|---|
| 最新运行状态、证据与下一步 | [当前状态](CURRENT.md)、[本次同步说明](docs/progress/repository-sync-20261001.md) |
| 最新运行状态、证据与下一步 | [当前状态](CURRENT.md)、[CPU/GPU 保存说明](registry/acceleration-20261001/README.md) |
| 顶层验收比例与历史基线 | [项目状态](docs/00-overview/status.md) |
| 目录和数据流 | [架构与目录](docs/00-overview/architecture.md) |
| 科学数据定义和来源 | [数据契约](docs/10-data/data-contract.md)、[来源登记](docs/10-data/provenance.md) |
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服务器项目根目录:`/data/digital-drosophila/`。
远程:`ssh://git@192.168.10.31:2222/qishizhe/digital-drosophila.git`。
初始化/当前远端默认分支:`codex/project-bootstrap`;最新研发分支:`codex/lif-author-semantics-lab`。
初始化/当前远端默认分支:`codex/project-bootstrap`;注册科学源码分支:`codex/lif-author-semantics-lab`;最新独立加速成果:`codex/v100-conditioning-acceleration`。
Git 保存源代码、配置、文档、书目、阶段证据副本和逐文件哈希清单。
**Git 不保存原始 SWC/Feather、CSR、完整事件/状态、模型 checkpoint、虚拟环境或大型压缩包。**
普通 Git 不直接保存大型科学二进制。获准公开再分发的原始/参考数据已在 `codex/lfs-public-resources` 通过 **Git LFS** 归档;本分支另通过 LFS 保存本次 CPU/GPU 回放的科学结果。没有上传虚拟环境、SDK 编译缓存、凭据或其他服务的数据。
原项目实占约 29.72 GB(十进制、初始化前统计),不会因为初始化 Git 被删除、搬移或重写。
仅 clone 本仓库不能恢复全数据;按[恢复说明](docs/30-reproducibility/restore.md)配置单独的数据副本。
只取得 Git pointer 不能恢复全数据;需下载对应分支的 LFS 对象并验证内部成员。本次恢复说明见 [CPU/GPU 发布入口](registry/acceleration-20261001/README.md)。这不是全服务器灾备。
## 安全的首次检查
```bash
git clone --branch codex/lif-author-semantics-lab ssh://git@192.168.10.31:2222/qishizhe/digital-drosophila.git
GIT_LFS_SKIP_SMUDGE=1 git clone --branch codex/v100-conditioning-acceleration ssh://git@192.168.10.31:2222/qishizhe/digital-drosophila.git
cd digital-drosophila
python3 -B tools/repo_guard.py
```