consolidate-main-preserve-science-lfs-cpu-gpu-history

README.md

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 截至 2026-10-01，最新正式封存科学阶段仍是 **Phase 4AQ：PASS-EXACT-UPDATED-BOUNDARY-ENGINEERING-NOT-LEARNING**。
 **Phase 4AR 已按用户要求停止，暂不恢复**：已提交 1,033/30,000 轮训练及 CPU 校验、138/3,920 次独立 probe；执行尚未完成，学习成功未判定。
-本分支 `codex/v100-conditioning-acceleration` 同时保留 CPU 与 GPU 方案及两轮独立性能回放。它不是已升级的生产运行时；原登记实验和权重没有改动。远端默认分支仍为初始化分支，见[分支说明](docs/40-operations/branches-20261001.md)。
+统一入口为 **`main`**，包含注册科学代码、CPU/GPU 两套方案及已公开的 LFS 数据。7 个旧分支的精确版本通过 `archive/2026-10-01/*` 标签保留，见[分支与恢复说明](docs/40-operations/branches-20261001.md)。这次只是仓库整理，不是生产运行时升级，也没有恢复训练。
 项目顶层验收口径为 **5/10（50%）**；这不是生物学逼真度、工作量完成率或剩余工期。
 最新正式候选运行时为 `MaleCNS-LIF-runtime-v2-deterministic-candidate`。
 `MaleCNS-TemporalEligibility-v2-candidate` 与 `MaleCNS-OlfactoryEncoder-v1-candidate` 保留。
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 | 科学数据定义和来源 | [数据契约](docs/10-data/data-contract.md)、[来源登记](docs/10-data/provenance.md) |
 | 模型边界 | [模型与冻结契约](docs/20-model/baseline.md) |
 | 论文、引用与证据用途 | [参考文献入口](references/README.md)、[证据边界](references/evidence-map.md) |
-| 环境与复现 | [环境](docs/30-reproducibility/environment.md)、[恢复](docs/30-reproducibility/restore.md) |
+| 环境与复现 | [环境](docs/30-reproducibility/environment.md)、[统一恢复入口](docs/30-reproducibility/main-restore.md) |
 | Git 同步、大数据备份与安全 | [同步说明](docs/40-operations/git-sync.md)、[备份](docs/40-operations/backup.md) |
 | 每个阶段的原始证据副本 | [阶段索引](registry/catalog-20260929/stages.json) |
 | 全部科学文件路径/大小/SHA-256 | [快照说明](registry/README.md) |
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 服务器项目根目录：`/data/digital-drosophila/`。
 远程：`ssh://git@192.168.10.31:2222/qishizhe/digital-drosophila.git`。
-初始化／当前远端默认分支：`codex/project-bootstrap`；注册科学源码分支：`codex/lif-author-semantics-lab`；最新独立加速成果：`codex/v100-conditioning-acceleration`。
+统一主分支：`main`。历史版本由归档标签保留；原注册科学源码仍固定为 `80aeb2093db655329774eff7b32fb6e417b8b40b`，不随主分支移动。
 
 Git 保存源代码、配置、文档、书目、阶段证据副本和逐文件哈希清单。
-普通 Git 不直接保存大型科学二进制。获准公开再分发的原始/参考数据已在 `codex/lfs-public-resources` 通过 **Git LFS** 归档；本分支另通过 LFS 保存本次 CPU/GPU 回放的科学结果。没有上传虚拟环境、SDK 编译缓存、凭据或其他服务的数据。
+普通 Git 不直接保存大型科学二进制。**Git LFS** 保存获准公开再分发的原始/参考数据，以及本次 CPU/GPU 回放结果；两套原归档指针均原样整合到 `main`。没有上传虚拟环境、SDK 编译缓存、凭据或其他服务的数据。
 原项目实占约 29.72 GB（十进制、初始化前统计），不会因为初始化 Git 被删除、搬移或重写。
-只取得 Git pointer 不能恢复全数据；需下载对应分支的 LFS 对象并验证内部成员。本次恢复说明见 [CPU/GPU 发布入口](registry/acceleration-20261001/README.md)。这不是全服务器灾备。
+只取得 Git pointer 不能恢复全数据；需按[统一恢复指南](docs/30-reproducibility/main-restore.md)下载所需 LFS 对象并验证内部成员。已封存报告中的旧分支命令仅作历史记录；不要据此重新运行实验。这不是全服务器灾备。
 
 ## 安全的首次检查
 
 ```bash
-GIT_LFS_SKIP_SMUDGE=1 git clone --branch codex/v100-conditioning-acceleration ssh://git@192.168.10.31:2222/qishizhe/digital-drosophila.git
+GIT_LFS_SKIP_SMUDGE=1 git clone --branch main ssh://git@192.168.10.31:2222/qishizhe/digital-drosophila.git
 cd digital-drosophila
 python3 -B tools/repo_guard.py
 ```