Audit frozen LIF semantics and real recurrent motifs without learning changes

This commit is contained in:
Digital Drosophila Archive
2026-09-30 01:00:16 +08:00
parent 3213aada79
commit 6fc326ccd1
55 changed files with 2809 additions and 26 deletions
@@ -0,0 +1,40 @@
[
{
"clause": "dg/dt = -g / tau",
"line_numbers_1based": [
46
]
},
{
"clause": "(unless refractory)",
"line_numbers_1based": [
45,
46
]
},
{
"clause": "v = v_rst; w = 0; g = 0 * mV",
"line_numbers_1based": [
52
]
},
{
"clause": "method='linear'",
"line_numbers_1based": [
163
]
},
{
"clause": "'v > v_th'",
"line_numbers_1based": [
50
]
},
{
"clause": "neu[i].rfc = 0 * ms",
"line_numbers_1based": [
92,
103
]
}
]
@@ -0,0 +1,7 @@
{
"documented_adaptation_not_GPU_regression": true,
"frozen_integrity_pass": true,
"goal_remains_active": true,
"new_model_authorization_separate": true,
"status": "COMPLETE-SEMANTICS-AUDIT / LEARNING-NOT-ACHIEVED"
}
@@ -0,0 +1,33 @@
neuron_idx,body_id,annotation_type,annotation_hemibrainType,annotation_flywireType,annotation_matchingNotes,neurotransmitter,nt_ground_truth
119,10133,lLN2F_b,lLN2F_b,lLN2F_b,,gaba,
153,10169,lLN2F_b,lLN2F_b,lLN2F_b,,gaba,
348,10376,lLN2F_b,lLN2F_b,lLN2F_b,,gaba,
478,10515,lLN2F_b,lLN2F_b,lLN2F_b,,gaba,
1495,11603,lLN2P_a,lLN2P_a,lLN2P_a,,gaba,
3104,13315,lLN2P_b,lLN2P_b,lLN2P_b,,gaba,gaba
6699,17325,lLN2P_a,lLN2P_a,lLN2P_a,,gaba,
7323,18016,lLN2P_c,lLN2P_c,lLN2P_c,,gaba,
7454,18165,lLN2P_b,lLN2P_b,lLN2P_b,,gaba,gaba
7955,18726,lLN2P_c,lLN2P_c,lLN2P_c,,gaba,
7959,18730,lLN2P_b,lLN2P_b,lLN2P_b,,gaba,gaba
8889,19767,lLN2P_b,lLN2P_b,lLN2P_b,,gaba,gaba
9025,19921,lLN2P_a,lLN2P_a,lLN2P_a,,gaba,
9447,20402,lLN2P_b,lLN2P_b,lLN2P_b,,gaba,gaba
9607,20581,lLN2P_c,lLN2P_c,lLN2P_c,,gaba,
9643,20620,lLN2P_b,lLN2P_b,lLN2P_b,,gaba,gaba
10488,21567,lLN2P_c,lLN2P_c,lLN2P_c,,gaba,
11035,22166,lLN2P_c,lLN2P_c,lLN2P_c,,gaba,
11106,22243,lLN2P_c,lLN2P_c,lLN2P_c,,gaba,
11136,22276,lLN2P_a,lLN2P_a,lLN2P_a,,gaba,
12550,23854,lLN2P_a,lLN2P_a,lLN2P_a,,gaba,
13411,24828,lLN2P_b,lLN2P_b,lLN2P_b,,gaba,gaba
15720,27416,lLN2P_b,lLN2P_b,lLN2P_b,,gaba,gaba
15896,27614,lLN2P_b,lLN2P_b,lLN2P_b,,gaba,gaba
16611,28406,lLN2P_c,lLN2P_c,lLN2P_c,,gaba,
16714,28525,lLN2P_b,lLN2P_b,lLN2P_b,,gaba,gaba
18392,30421,lLN2P_b,lLN2P_b,lLN2P_b,,gaba,gaba
22591,35196,lLN2P_a,lLN2P_a,lLN2P_a,,gaba,
96266,130279,lLN2P_b,lLN2P_b,lLN2P_b,,gaba,gaba
123710,267437,lLN2P_c,lLN2P_c,lLN2P_c,,gaba,
141783,551294,lLN2P_c,lLN2P_c,lLN2P_c,,gaba,
164024,918582,lLN2P_a,lLN2P_a,lLN2P_a,,gaba,
1 neuron_idx body_id annotation_type annotation_hemibrainType annotation_flywireType annotation_matchingNotes neurotransmitter nt_ground_truth
2 119 10133 lLN2F_b lLN2F_b lLN2F_b gaba
3 153 10169 lLN2F_b lLN2F_b lLN2F_b gaba
4 348 10376 lLN2F_b lLN2F_b lLN2F_b gaba
5 478 10515 lLN2F_b lLN2F_b lLN2F_b gaba
6 1495 11603 lLN2P_a lLN2P_a lLN2P_a gaba
7 3104 13315 lLN2P_b lLN2P_b lLN2P_b gaba gaba
8 6699 17325 lLN2P_a lLN2P_a lLN2P_a gaba
9 7323 18016 lLN2P_c lLN2P_c lLN2P_c gaba
10 7454 18165 lLN2P_b lLN2P_b lLN2P_b gaba gaba
11 7955 18726 lLN2P_c lLN2P_c lLN2P_c gaba
12 7959 18730 lLN2P_b lLN2P_b lLN2P_b gaba gaba
13 8889 19767 lLN2P_b lLN2P_b lLN2P_b gaba gaba
14 9025 19921 lLN2P_a lLN2P_a lLN2P_a gaba
15 9447 20402 lLN2P_b lLN2P_b lLN2P_b gaba gaba
16 9607 20581 lLN2P_c lLN2P_c lLN2P_c gaba
17 9643 20620 lLN2P_b lLN2P_b lLN2P_b gaba gaba
18 10488 21567 lLN2P_c lLN2P_c lLN2P_c gaba
19 11035 22166 lLN2P_c lLN2P_c lLN2P_c gaba
20 11106 22243 lLN2P_c lLN2P_c lLN2P_c gaba
21 11136 22276 lLN2P_a lLN2P_a lLN2P_a gaba
22 12550 23854 lLN2P_a lLN2P_a lLN2P_a gaba
23 13411 24828 lLN2P_b lLN2P_b lLN2P_b gaba gaba
24 15720 27416 lLN2P_b lLN2P_b lLN2P_b gaba gaba
25 15896 27614 lLN2P_b lLN2P_b lLN2P_b gaba gaba
26 16611 28406 lLN2P_c lLN2P_c lLN2P_c gaba
27 16714 28525 lLN2P_b lLN2P_b lLN2P_b gaba gaba
28 18392 30421 lLN2P_b lLN2P_b lLN2P_b gaba gaba
29 22591 35196 lLN2P_a lLN2P_a lLN2P_a gaba
30 96266 130279 lLN2P_b lLN2P_b lLN2P_b gaba gaba
31 123710 267437 lLN2P_c lLN2P_c lLN2P_c gaba
32 141783 551294 lLN2P_c lLN2P_c lLN2P_c gaba
33 164024 918582 lLN2P_a lLN2P_a lLN2P_a gaba
@@ -0,0 +1,8 @@
{
"all_CPU_GPU_exact": true,
"alternative_MaleCNS_dynamics_run": false,
"learning_achieved": false,
"original_author_code_executed": false,
"real_motifs_frozen_only": 5,
"synthetic_policies": 4
}
@@ -0,0 +1,14 @@
edge_id,source_neuron_idx,target_neuron_idx,raw_count,source_body_id,target_body_id
1336648,1197,1381,210,11289,11478
1336655,1197,1511,172,11289,11620
1337065,1197,133666,104,11289,527577
1467340,1381,1197,259,11478,11289
1467355,1381,1511,235,11478,11620
1467852,1381,133666,64,11478,527577
1559765,1511,1197,226,11620,11289
1559772,1511,1381,283,11620,11478
1560267,1511,133666,70,11620,527577
20992285,133666,1197,95,527577,11289
20992291,133666,1381,57,527577,11478
20992294,133666,1511,76,527577,11620
20992891,133666,82312,43,527577,109321
1 edge_id source_neuron_idx target_neuron_idx raw_count source_body_id target_body_id
2 1336648 1197 1381 210 11289 11478
3 1336655 1197 1511 172 11289 11620
4 1337065 1197 133666 104 11289 527577
5 1467340 1381 1197 259 11478 11289
6 1467355 1381 1511 235 11478 11620
7 1467852 1381 133666 64 11478 527577
8 1559765 1511 1197 226 11620 11289
9 1559772 1511 1381 283 11620 11478
10 1560267 1511 133666 70 11620 527577
11 20992285 133666 1197 95 527577 11289
12 20992291 133666 1381 57 527577 11478
13 20992294 133666 1511 76 527577 11620
14 20992891 133666 82312 43 527577 109321
@@ -0,0 +1,8 @@
item,author,frozen_adapted
spike reset g,reset to zero,retain g
g during refractory,ODE paused; synaptic writes blocked,decay and accept arrivals
integration,linear exact state updater,forward Euler with decayed g
threshold,strict >,>=
within-step arrivals,"after integration, before reset",before integration
stimulated neurons,voltage Poisson input; refractory=0,forced spikes subject to 22-step refractory
W_syn,free parameter calibrated on FlyWire feeding response,same value transferred to MaleCNS; not independently measured
1 item author frozen_adapted
2 spike reset g reset to zero retain g
3 g during refractory ODE paused; synaptic writes blocked decay and accept arrivals
4 integration linear exact state updater forward Euler with decayed g
5 threshold strict > >=
6 within-step arrivals after integration, before reset before integration
7 stimulated neurons voltage Poisson input; refractory=0 forced spikes subject to 22-step refractory
8 W_syn free parameter calibrated on FlyWire feeding response same value transferred to MaleCNS; not independently measured