Archive MaleCNS research sources, provenance, bibliography and immutable data inventory

2026-09-29 03:38:32 +08:00
commit 3981628ff8
682 changed files with 161475 additions and 0 deletions
@@ -0,0 +1,20 @@
+# 文献证据与建模边界
+
+| 主题 | 主来源（DOI） | 用途与局限 |
+|---|---|---|
+| 正式 MaleCNS | 10.1016/j.cell.2026.08.015 | 166,700 neurons / 11,710 types 的论文口径；不覆盖本地 schema 差异 |
+| 官方视觉通路 | 10.1016/j.cell.2026.08.014 | pathway/retinotopy 的作者资源；不能补造缺失坐标 |
+| Shiu-like LIF | 10.1038/s41586-024-07763-9 | 全脑计算模型参考；数据集、transmitter inventory 与本项目不同 |
+| FlyVis | 10.1038/s41586-024-07939-3 | 独立视觉模型/engineering front-end，不共享 MaleCNS body ID |
+| DoOR | 10.1038/srep21841 | 气味响应/受体通道来源，不是 MaleCNS 每个 neuron 的实测响应 |
+| NT 自动识别 | 10.1016/j.cell.2024.03.016 | EM transmitter 分类与局限；不能把其他数据集误分类直接当本地 sign 真值 |
+| DPM physiology | 10.7554/eLife.03868 | 支持研究 GABA/5HT 与慢调制；不自动给所有目标统一 sign |
+| APL 局部抑制 | 10.7554/eLife.56954；10.7554/eLife.74172 | 局部、PN bouton/KC dendrite 等机制；不提供本项目整细胞负电流系数 |
+| MB→AL feedback | 10.1073/pnas.0914912107 | 反馈存在的生理研究；项目具体路径仍须真实边和事件支持 |
+| AL 兴奋回路 | 10.1016/j.cell.2006.12.034；10.1016/j.neuron.2010.08.025 | 不能因模型爆发就随意改变真实 ACh 分类 |
+| 时序塑性 | 10.1016/j.cell.2019.05.040；10.1016/j.cell.2015.11.019 | compartment/timing-dependent，不把 positive reward 等同全体 PAM 增强 |
+| KC→MBON efficacy | 10.7554/eLife.76712；10.1523/ENEURO.0275-23.2023；10.7554/eLife.80445 | presynaptic/postsynaptic 不同位置和条件，不能编造统一 MaleCNS 数值 |
+| 身体物理与 Google DeepMind | 10.1038/s41586-025-09029-4 | FlyBody 是独立运动/物理研究，不证明冻结 MaleCNS 已具备自主关联学习 |
+
+区分四层：原始数据事实、论文观察、工程模型假设、当前实验结论。所有引用都不能替代本项目的 held-out、control、确定性与因果验证。
+更多阶段-specific 文献评估保留在 catalog 的 literature-audit 及原模型源码中，不因本次总览而覆盖旧解释。