# 数据契约

唯一正式全脑连接组输入：`datasets/male-cns-v1.0/processed/neuron-only/`。

| 项目 | 固定值 / 语义 |
|---|---|
| canonical neurons | 166,700；annotation 的 superclass 非空 |
| fragments | 44,877；从 neuron-only 图排除，仍保留原数据与审计 |
| annotation bodies | 211,577；不能全部称为 neurons |
| directed edges | 25,582,938 |
| anatomical synaptic-contact sum | 124,177,617 |
| neuron_idx | 连续 int32，0…166699 |
| body_id | 原始 uint64；不可与其他数据集 ID 混用 |
| CSR indptr / indices / raw weights | int64 / int32 / int64 |
| isolated neurons / self-loops | 保留 217 / 101 |
| missing type | 保留 2,194 个 neurons |
| nonempty raw type unique strings | 11,751；不为匹配论文数字手工合并 |

上表是已经封存的项目契约，不是本次重新计算的结果；以原 Phase 3B 审计、schema 和 manifest 为权威依据。
正式 Cell 论文神经元总数为 166,700、types 11,710；与本地 raw 字符串统计不一致时保留版本/定义差异。

原始文件实际位置：

- `raw/annotations/body-annotations-male-cns-v1.0-minconf-0.5.feather`
- `raw/annotations/body-neurotransmitters-male-cns-v1.0.feather`（不是空的 raw/neurotransmitters 目录）
- `raw/connectivity/connectome-weights-male-cns-v1.0-minconf-0.5.feather`
- `raw/skeletons/`：本次清点 211,573 个 SWC 文件；这不是 neuron-only 的 SWC 覆盖数。

不得由 SWC 文件总数推断 neuron coverage；需用 canonical body_id 做集合连接。不得改动 raw 以匹配论文。
本项目没有下载原始 EM 图像。所有新增解释字段与原始 neurotransmitter 字段分离。